Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCM1Q9NP62 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCM1Q9NP62 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM1Q9NP62 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCM1Q9NP62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM1Q9NP62 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1277.8 ms