Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRPL47Q9HD33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL47Q9HD33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPL47Q9HD33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL47Q9HD33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPL47Q9HD33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL47Q9HD33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRPL47Q9HD33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms