Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK6Q9HC98 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEK6Q9HC98 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK6Q9HC98 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEK6Q9HC98 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEK6Q9HC98 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms