Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POPDC3Q9HBV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POPDC3Q9HBV1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POPDC3Q9HBV1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POPDC3Q9HBV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POPDC3Q9HBV1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POPDC3Q9HBV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POPDC3Q9HBV1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POPDC3Q9HBV1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms