Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARX1Q9HBU1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARX1Q9HBU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX1Q9HBU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARX1Q9HBU1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms