Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PARVBQ9HBI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARVBQ9HBI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARVBQ9HBI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PARVBQ9HBI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARVBQ9HBI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms