Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NTN4Q9HB63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTN4Q9HB63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTN4Q9HB63 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTN4Q9HB63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTN4Q9HB63 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTN4Q9HB63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms