Protein–RNA interactions for Protein: Q9H981

ACTR8, Actin-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR8Q9H981 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTR8Q9H981 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR8Q9H981 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR8Q9H981 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTR8Q9H981 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR8Q9H981 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms