Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms