Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7J1

PPP1R3E, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3EQ9H7J1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3EQ9H7J1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3EQ9H7J1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R3EQ9H7J1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R3EQ9H7J1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms