Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMYD3Q9H7B4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD3Q9H7B4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMYD3Q9H7B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD3Q9H7B4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD3Q9H7B4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD3Q9H7B4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD3Q9H7B4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD3Q9H7B4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD3Q9H7B4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMYD3Q9H7B4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMYD3Q9H7B4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMYD3Q9H7B4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms