Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF3Q9GZM5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF3Q9GZM5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF3Q9GZM5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF3Q9GZM5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms