Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM9Q9C026 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM9Q9C026 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM9Q9C026 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM9Q9C026 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM9Q9C026 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM9Q9C026 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM9Q9C026 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM9Q9C026 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM9Q9C026 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM9Q9C026 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM9Q9C026 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM9Q9C026 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM9Q9C026 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM9Q9C026 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms