Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUF2Q9BZD4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUF2Q9BZD4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUF2Q9BZD4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUF2Q9BZD4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUF2Q9BZD4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUF2Q9BZD4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms