Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP1-5Q9BYS1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP1-5Q9BYS1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-5Q9BYS1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRTAP1-5Q9BYS1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms