Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM175Q9BSA9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM175Q9BSA9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM175Q9BSA9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM175Q9BSA9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM175Q9BSA9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM175Q9BSA9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM175Q9BSA9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM175Q9BSA9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM175Q9BSA9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM175Q9BSA9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM175Q9BSA9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM175Q9BSA9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM175Q9BSA9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM175Q9BSA9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM175Q9BSA9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM175Q9BSA9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM175Q9BSA9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM175Q9BSA9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms