Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3AQ99856 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3AQ99856 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARID3AQ99856 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3AQ99856 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms