Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRRX2Q99811 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRRX2Q99811 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRRX2Q99811 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRRX2Q99811 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRRX2Q99811 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRRX2Q99811 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRRX2Q99811 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRRX2Q99811 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRRX2Q99811 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRRX2Q99811 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms