Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POP1Q99575 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POP1Q99575 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POP1Q99575 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POP1Q99575 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POP1Q99575 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POP1Q99575 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POP1Q99575 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POP1Q99575 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POP1Q99575 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POP1Q99575 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POP1Q99575 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POP1Q99575 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POP1Q99575 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POP1Q99575 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POP1Q99575 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POP1Q99575 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POP1Q99575 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POP1Q99575 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POP1Q99575 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POP1Q99575 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POP1Q99575 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POP1Q99575 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POP1Q99575 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POP1Q99575 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POP1Q99575 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POP1Q99575 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
POP1Q99575 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POP1Q99575 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POP1Q99575 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POP1Q99575 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POP1Q99575 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POP1Q99575 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POP1Q99575 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POP1Q99575 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POP1Q99575 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POP1Q99575 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POP1Q99575 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POP1Q99575 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POP1Q99575 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POP1Q99575 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POP1Q99575 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POP1Q99575 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POP1Q99575 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POP1Q99575 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POP1Q99575 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POP1Q99575 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POP1Q99575 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POP1Q99575 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POP1Q99575 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POP1Q99575 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POP1Q99575 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POP1Q99575 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POP1Q99575 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POP1Q99575 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POP1Q99575 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POP1Q99575 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POP1Q99575 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POP1Q99575 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POP1Q99575 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POP1Q99575 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POP1Q99575 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
POP1Q99575 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POP1Q99575 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POP1Q99575 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POP1Q99575 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POP1Q99575 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POP1Q99575 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POP1Q99575 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POP1Q99575 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POP1Q99575 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POP1Q99575 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POP1Q99575 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POP1Q99575 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POP1Q99575 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POP1Q99575 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POP1Q99575 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POP1Q99575 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POP1Q99575 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POP1Q99575 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POP1Q99575 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POP1Q99575 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POP1Q99575 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POP1Q99575 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POP1Q99575 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POP1Q99575 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
POP1Q99575 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POP1Q99575 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POP1Q99575 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POP1Q99575 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POP1Q99575 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POP1Q99575 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POP1Q99575 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POP1Q99575 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POP1Q99575 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POP1Q99575 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POP1Q99575 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POP1Q99575 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POP1Q99575 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POP1Q99575 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms