Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHOX2BQ99453 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PHOX2BQ99453 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHOX2BQ99453 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHOX2BQ99453 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHOX2BQ99453 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHOX2BQ99453 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHOX2BQ99453 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHOX2BQ99453 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHOX2BQ99453 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHOX2BQ99453 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHOX2BQ99453 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHOX2BQ99453 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms