Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DERL3Q96Q80 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DERL3Q96Q80 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DERL3Q96Q80 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DERL3Q96Q80 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms