Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC9Q96Q05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC9Q96Q05 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC9Q96Q05 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms