Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA5Q96PV4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PNMA5Q96PV4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA5Q96PV4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA5Q96PV4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA5Q96PV4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA5Q96PV4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms