Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF396Q96N95 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF396Q96N95 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF396Q96N95 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZNF396Q96N95 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF396Q96N95 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF396Q96N95 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms