Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL15Q96M94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL15Q96M94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL15Q96M94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms