Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC74BQ96LY2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC74BQ96LY2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC74BQ96LY2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC74BQ96LY2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC74BQ96LY2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms