Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPZA3Q96KX2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPZA3Q96KX2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPZA3Q96KX2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPZA3Q96KX2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPZA3Q96KX2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms