Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDLIM2Q96JY6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDLIM2Q96JY6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDLIM2Q96JY6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDLIM2Q96JY6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDLIM2Q96JY6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDLIM2Q96JY6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDLIM2Q96JY6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDLIM2Q96JY6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDLIM2Q96JY6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDLIM2Q96JY6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDLIM2Q96JY6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms