Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC45A3Q96JT2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC45A3Q96JT2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC45A3Q96JT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC45A3Q96JT2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC45A3Q96JT2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC45A3Q96JT2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC45A3Q96JT2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms