Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM5Q96HS1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM5Q96HS1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAM5Q96HS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAM5Q96HS1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms