Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAMBPL1Q96FJ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAMBPL1Q96FJ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
STAMBPL1Q96FJ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
STAMBPL1Q96FJ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
STAMBPL1Q96FJ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAMBPL1Q96FJ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAMBPL1Q96FJ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAMBPL1Q96FJ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAMBPL1Q96FJ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STAMBPL1Q96FJ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms