Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL1Q96FI4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEIL1Q96FI4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL1Q96FI4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms