Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM11Q96F44 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM11Q96F44 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM11Q96F44 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM11Q96F44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM11Q96F44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM11Q96F44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM11Q96F44 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM11Q96F44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM11Q96F44 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM11Q96F44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms