Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MALSU1Q96EH3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MALSU1Q96EH3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MALSU1Q96EH3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms