Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RERGQ96A58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RERGQ96A58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RERGQ96A58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RERGQ96A58 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RERGQ96A58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms