Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A1Q93096 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTP4A1Q93096 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTP4A1Q93096 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A1Q93096 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A1Q93096 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms