Protein–RNA interactions for Protein: Q92871

PMM1, Phosphomannomutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM1Q92871 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMM1Q92871 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMM1Q92871 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMM1Q92871 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMM1Q92871 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMM1Q92871 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMM1Q92871 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMM1Q92871 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms