Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORBQ92753 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORBQ92753 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORBQ92753 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORBQ92753 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORBQ92753 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORBQ92753 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORBQ92753 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORBQ92753 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORBQ92753 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RORBQ92753 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RORBQ92753 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RORBQ92753 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RORBQ92753 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RORBQ92753 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RORBQ92753 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RORBQ92753 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORBQ92753 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORBQ92753 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RORBQ92753 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORBQ92753 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RORBQ92753 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RORBQ92753 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RORBQ92753 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RORBQ92753 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RORBQ92753 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RORBQ92753 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RORBQ92753 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RORBQ92753 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RORBQ92753 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RORBQ92753 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RORBQ92753 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RORBQ92753 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORBQ92753 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORBQ92753 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RORBQ92753 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RORBQ92753 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RORBQ92753 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RORBQ92753 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORBQ92753 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RORBQ92753 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RORBQ92753 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORBQ92753 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORBQ92753 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORBQ92753 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORBQ92753 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORBQ92753 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORBQ92753 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORBQ92753 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORBQ92753 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RORBQ92753 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORBQ92753 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORBQ92753 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORBQ92753 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORBQ92753 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORBQ92753 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORBQ92753 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORBQ92753 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORBQ92753 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RORBQ92753 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RORBQ92753 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RORBQ92753 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORBQ92753 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RORBQ92753 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RORBQ92753 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RORBQ92753 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORBQ92753 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORBQ92753 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORBQ92753 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RORBQ92753 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RORBQ92753 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORBQ92753 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORBQ92753 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORBQ92753 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORBQ92753 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORBQ92753 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORBQ92753 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORBQ92753 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORBQ92753 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORBQ92753 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORBQ92753 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORBQ92753 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORBQ92753 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORBQ92753 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RORBQ92753 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RORBQ92753 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RORBQ92753 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORBQ92753 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORBQ92753 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORBQ92753 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORBQ92753 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORBQ92753 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORBQ92753 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORBQ92753 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORBQ92753 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORBQ92753 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORBQ92753 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RORBQ92753 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORBQ92753 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORBQ92753 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms