Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCDQ92629 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGCDQ92629 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCDQ92629 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGCDQ92629 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGCDQ92629 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms