Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BAP1Q92560 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BAP1Q92560 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BAP1Q92560 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BAP1Q92560 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BAP1Q92560 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BAP1Q92560 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BAP1Q92560 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BAP1Q92560 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BAP1Q92560 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BAP1Q92560 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BAP1Q92560 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms