Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF12Q8WXF0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF12Q8WXF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF12Q8WXF0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF12Q8WXF0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF12Q8WXF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms