Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q2Q8WVN8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2Q2Q8WVN8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE2Q2Q8WVN8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2Q2Q8WVN8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2Q2Q8WVN8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2Q2Q8WVN8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2Q2Q8WVN8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2Q2Q8WVN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2Q2Q8WVN8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2Q2Q8WVN8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2Q2Q8WVN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms