Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB2BQ8WUD1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB2BQ8WUD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB2BQ8WUD1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB2BQ8WUD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB2BQ8WUD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms