Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3BQ8TF42 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3BQ8TF42 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3BQ8TF42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBASH3BQ8TF42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3BQ8TF42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms