Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MDM1Q8TC05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM1Q8TC05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM1Q8TC05 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM1Q8TC05 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms