Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC110Q8TBZ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC110Q8TBZ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC110Q8TBZ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC110Q8TBZ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC110Q8TBZ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC110Q8TBZ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms