Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBM7

TMEM254, Transmembrane protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM254Q8TBM7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM254Q8TBM7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM254Q8TBM7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM254Q8TBM7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM254Q8TBM7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms