Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIN3Q8TB24 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIN3Q8TB24 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIN3Q8TB24 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIN3Q8TB24 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIN3Q8TB24 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIN3Q8TB24 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIN3Q8TB24 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIN3Q8TB24 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIN3Q8TB24 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIN3Q8TB24 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIN3Q8TB24 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms