Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI38

NFKBID, NF-kappa-B inhibitor delta, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIDQ8NI38 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIDQ8NI38 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIDQ8NI38 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIDQ8NI38 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIDQ8NI38 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIDQ8NI38 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIDQ8NI38 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIDQ8NI38 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIDQ8NI38 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms