Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PATJQ8NI35 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PATJQ8NI35 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PATJQ8NI35 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PATJQ8NI35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PATJQ8NI35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PATJQ8NI35 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PATJQ8NI35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PATJQ8NI35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PATJQ8NI35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PATJQ8NI35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PATJQ8NI35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PATJQ8NI35 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PATJQ8NI35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PATJQ8NI35 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PATJQ8NI35 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PATJQ8NI35 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PATJQ8NI35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PATJQ8NI35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PATJQ8NI35 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms